因手足口病幼儿园停课，学费应退还。依据《相关法律法规》，若校方原因导致无法上课，学生有权要求退费，学校应退剩余费用。只退伙食费可能不合理，若不及时处理，可能损害家长权益，影响学校声誉。
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学费应退。操作如下：1.查看协议中退费条款，按约定执行；2.若无约定，与学校沟通协商，要求退还合理费用；3.协商不成，保留证据，向教育部门反映或寻求法律途径解决。
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学费退还政策需协商或依据协议。建议先查看与幼儿园签订的协议，无明确条款时可与学校协商。若协商无果，可寻求法律援助或向教育部门投诉，根据具体情况选择合适方式。