没有结婚证不算合法夫妻。依据《婚姻法》，只有办理结婚证才确立夫妻关系，未领证属同居，非婚生子女上户需缴社会抚养金。不及时处理可能导致子女权益受损，如教育、医疗等保障受影响。
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此情况常见处理为补办结婚证或保持同居。选择补办可获法律认可夫妻关系，享受相应权益；保持同居则需关注子女权益，如办理户口、教育等。
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非婚同居不算夫妻。处理方式：1.补办结婚证，成为合法夫妻，享受婚姻法律保障；2.保持现状，但需为子女办理相关手续，如户口、上学等，可能需缴纳社会抚养金；3.分开，需协商或诉讼解决子女抚养、财产分割问题。